Научно-методический совет является коллегиальным совещательно-рекомендательным органом, обеспечивающим разработку и реализацию мероприятий, направленных на повышение качества научно-методического обеспечения образовательных программ второго и третьего уровней получения православного церковного образования (второй ступени высшего образования и первой ступени послевузовского образования по специальности «Теология»). В своей деятельности подотчетен ректору и Ученому совету Минской духовной академии.
Состав Научно-методического совета Минской духовной академии: