Согласно Уставу Минской духовной академии, Ученый совет является высшим коллегиальным органом управления академии, в компетенцию которого входят основные вопросы академической деятельности.
Ученый совет состоит из Патриаршего Экзарха, ректора (председателя Ученого совета), проректоров, ученого секретаря, заведующих кафедрами, представителей профессорско-преподавательского состава.
Протоколы Ученого совета утверждаются Патриаршим Экзархом, после чего решения Ученого совета вступают в силу.
В настоящее время Ученый совет работает в следующем составе:
- Митрополит Минский и Заславский Вениамин, Патриарший Экзарх всея Беларуси
- Архимандрит Афанасий (Соколов), ректор Минской духовной академии, кандидат богословия – председатель
- Иерей Виктор Кулага, проректор по воспитательной работе, кандидат богословия
- Слесарев Александр Валерьевич, проректор по научной работе, доцент, кандидат богословия
- Протоиерей Сергий Гордун, заведующий кафедрой библеистики и богословия, кандидат богословия, профессор
- Теплова Валентина Анатольевна, заведующая кафедрой церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат исторических наук, профессор
- Мартинович Владимир Александрович, заведующий кафедрой апологетики, доцент, доктор теологии (Венского университета), кандидат социологических наук, доцент
- Протоиерей Владимир Башкиров, профессор кафедры библеистики и богословия, доктор богословия
- Иерей Гордей Щеглов, профессор кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, доктор церковной истории
- Протоиерей Николай Болоховский, доцент кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат богословия
- Иерей Константин Голубев, доктор экономических наук, доцент
- Гронский Александр Дмитриевич, кандидат исторических наук, доцент
- Шатравский Сергей Иосифович, доцент кафедры апологетики, кандидат богословия
- Протоиерей Андрей Волков, старший преподаватель кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат богословия
- Протоиерей Александр Романчук, кандидат богословия, старший преподаватель, председатель Синодальной исторической комиссии
- Протоиерей Иоанн Задорожин, кандидат богословия, старший преподаватель
- Протоиерей Сергий Мовсесян, кандидат богословия, кандидат философских наук, старший преподаватель
- Иеромонах Андрей (Василюк), кандидат богословия, преподаватель — секретарь Ученого совета.
