Согласно Уставу Минской духовной академии, Ученый совет является высшим коллегиальным органом управления академии, в компетенцию которого входят основные вопросы академической деятельности.
Ученый совет состоит из Патриаршего Экзарха, ректора (председателя Ученого совета), проректоров, ученого секретаря, заведующих кафедрами, представителей профессорско-преподавательского состава.
Протоколы Ученого совета утверждаются Патриаршим Экзархом, после чего решения Ученого совета вступают в силу.
В настоящее время Ученый совет работает в следующем составе:
- Митрополит Минский и Заславский Павел, Патриарший Экзарх всея Беларуси
- Архимандрит Сергий (Акимов), ректор, заведующий кафедрой библеистики и богословия, профессор, доктор богословия – председатель
- Протоиерей Владимир Долгополов, первый проректор, магистр богословия
- Диакон Андрей Бабушкин, проректор по воспитательной работе, магистр богословия
- Слесарев Александр Валерьевич, проректор по научной работе, заведующий кафедрой церковной истории и церковно-практических дисциплин, доцент, кандидат богословия
- Иерей Владимир Мультан, проректор по административно-хозяйственной и финансово-экономической деятельности
- Мартинович Владимир Александрович, заведующий кафедрой апологетики, доцент, доктор теологии (Венского университета), кандидат социологических наук
- Протоиерей Владимир Башкиров, профессор кафедры библеистики и богословия, доктор богословия
- Иерей Гордей Щеглов, профессор кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, доктор церковной истории
- Протоиерей Сергий Гордун, профессор кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат богословия, первый проректор Института теологии БГУ
- Теплова Валентина Анатольевна, профессор кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат исторических наук
- Протоиерей Николай Болоховский, доцент кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат богословия
- Протоиерей Алексей Васин, доцент кафедры библеистики и богословия, кандидат богословия
- Протоиерей Андрей Волков, преподаватель кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат богословия
- Иерей Сергий Тимошенков, доцент кафедры апологетики, кандидат богословия
- Иерей Святослав Рогальский, доцент кафедры библеистики и богословия, кандидат богословия
- Протоиерей Сергий Мовсесян, преподаватель кафедры апологетики, кандидат богословия, кандидат философских наук
- Иерей Роман Артемов, заведующий отделением заочного обучения, магистр философских наук
- Шатравский Сергей Иосифович, доцент кафедры апологетики, кандидат богословия
- Гронский Александр Дмитриевич, доцент кафедры церковной истории и церковно-практических дисциплин, кандидат исторических наук – секретарь Ученого совета.
