В 2015 г. в зданиях первого учебного корпуса и ректората Духовно-образовательного центра Белорусской Православной Церкви начал работу Церковно-исторический музей Белорусской Православной Церкви при Минской духовной академии. Решение о создании музея было принято на заседании Синода Белорусской Православной Церкви 28 марта 2013 г. (Журнал № 5). Официальное открытие музея состоялось 25 октября 2015 г.
Музейные фонды формировались на основе коллекции церковных древностей, собранной митрополитом Филаретом (Вахромеевым), почетным Патриаршим Экзархом всея Беларуси (†2021).
Разработка концепции музея проводилась при содействии кафедры истории и теории христианского искусства факультета церковных художеств Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета и кафедры церковных искусств и археологии Общецерковной аспирантуры и докторантуры имени святых равноапостольных Кирилла и Мефодия.
Музейное собрание, представленное в трех залах, рассказывает об истории Православной Церкви на землях Беларуси.
Синий зал посвящен церковному искусству. Выставленные в нем художественные произведения иллюстрируют то, как в иконе и архитектуре храма отражены богословие, замысел заказчика и общепринятый художественный стиль.
Красный зал посвящен истории Церкви в ХХ в. Представленные в нем предметы и фотоматериалы рассказывают о подвиге мученичества и исповедничества в период гонений на Церковь. В настоящее время Красный зал находится на реконструкции.
Зеленый зал повествует о жизни человека, с которым связано начало церковного возрождения в Республике Беларусь. Здесь представлена история служения на Белорусской земле митрополита Филарета (Вахромеева), личные вещи архипастыря.
21 марта 2021 года, в день рождения митрополита Филарета, первого Патриаршего Экзарха всея Беларуси, состоялось открытие мемориального кабинета приснопоминаемого архипастыря. Экспозиция разместилась на базе Церковно-исторического музея Белорусской Православной Церкви в городе Минске. Торжественная церемония открытия кабинета началась в храме святителя Кирилла Туровского при Минской духовной академии с заупокойной литии, которую совершил по усопшему архипастырю митрополит Минский и Заславский Вениамин, Патриарший Экзарх всея Беларуси. Среди почетных гостей были епископ Слуцкий и Солигорский Антоний, уполномоченный по делам религий и национальностей Республики Беларусь Александр Румак.
Новости академии с упоминанием музея БПЦ

Вопросы развития религиозного туризма обсудили в Академии
16 января 2025 года на базе Академии состоялось заседание рабочей группы по развитию религиозного туризма. Группа создана Межведомственным экспертно-координационным советом по туризму при Совете Министров Республики Беларусь.

Академию посетил ректор Санкт-Петербургской духовной академии епископ Силуан (Никитин)
26-27 ноября 2024 года ректор Санкт-Петербургской духовной академии епископ Силуан (Никитин) посетил Минскую духовную академию по случаю Актового дня.

Академию посетил митрополит Казанский и Татарстанский Кирилл
14 июля 2024 года Минскую духовную академию посетил митрополит Казанский и Татарстанский Кирилл.

Академию посетил ректор Московских духовных школ
2 июля 2024 года епископ Сергиево-Посадский и Дмитровский Кирилл (Зинковский), ректор Московской духовной академии, посетил Минскую духовную академию.

Академию посетили представители Белорусского государственного университета культуры и искусств
23 апреля 2024 года Минскую духовную академию посетили преподаватели и студенты первого курса факультета информационно-документных коммуникаций Белорусского государственного университета культуры и искусств (г. Минск).

Сотрудники Фундаментальной библиотеки БГУ посетили Минскую духовную академию
4 апреля 2024 года Минскую духовную академию с дружеским визитом посетили сотрудники Фундаментальной библиотеки БГУ.

Митрополит Симферопольский и Крымский Тихон (Шевкунов) посетил Минскую духовную академию
30 марта 2024 года председатель Патриаршего совета по культуре, митрополит Симферопольский и Крымский Тихон (Шевкунов) посетил Минскую духовную академию.

Студенты МПГУ посетили Академию
28 марта 2024 года группа студентов филиала Московского педагогического государственного университета (г. Черняховск) посетили Минскую духовную академию.

Академию посетили митрополит Калужский Климент и митрополит Псковский Арсений
2 марта 2024 года Минскую духовную академию посетили митрополит Калужский Климент (Капалин), председатель Издательского Совета Русской Православной Церкви, и митрополит Псковский и Порховский Арсений (Перевалов).

Академию посетили воспитанницы Отделения церковных искусств Минской духовной семинарии
31 января 2024 года воспитанницы Отделения церковных искусств Минской духовной семинарии в рамках поездки в г. Минск посетили Минскую духовную академию.